深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）
云南百滇稅務(wù)師事務(wù)所有限公司 2020-08-30
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深圳市科技創(chuàng)新委員會(huì) 國(guó)家稅務(wù)總局深圳市稅務(wù)局關(guān)于公開(kāi)征求《深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）》意見(jiàn)的通告為進(jìn)一步優(yōu)化和完善技術(shù)市場(chǎng)政策體系，促進(jìn)科技與經(jīng)濟(jì)結(jié)合，保障國(guó)家有關(guān)技術(shù)市場(chǎng)稅收優(yōu)惠政策的落實(shí)，結(jié)合我市技術(shù)合同認(rèn)定登記工作和相關(guān)技術(shù)性收入減免稅情況，深圳市科技創(chuàng)新委員會(huì)和國(guó)家稅務(wù)總局深圳市稅務(wù)局共同組織修訂了《深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）》。為保障公眾的知情權(quán)和參與權(quán)，提高文件草擬質(zhì)量，根據(jù)《深圳市行政機(jī)關(guān)規(guī)范性文件管理規(guī)定》（市政府令第 305 號(hào)），現(xiàn)就本管理辦法公開(kāi)征求社會(huì)公眾意見(jiàn)。有關(guān)單位和社會(huì)各界人士可在 2020年9月30日前，通過(guò)以下方式反饋：
1.通過(guò)信函方式:將意見(jiàn)寄至深圳市福田區(qū)上步中路1001號(hào)深圳科技大廈1017室，深圳市技術(shù)市場(chǎng)管理辦公室收，聯(lián)系電話：83672276（郵編 518031），并請(qǐng)?jiān)谛欧馍献⒚?ldquo;規(guī)范性文件征求意見(jiàn)”字樣。
2.通過(guò)電子郵件方式將意見(jiàn)發(fā)送至：xianbing@sticmail.sz.gov.cn。
附件：
1.深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）
2.《深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）》起草說(shuō)明
深圳市科技創(chuàng)新委員會(huì)
國(guó)家稅務(wù)總局深圳市稅務(wù)局
2020年8月28日
深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（征求意見(jiàn)稿）
第一章 總則
第一條 根據(jù)《技術(shù)合同認(rèn)定登記管理辦法》（國(guó)科發(fā)政字〔2000〕063號(hào)）、《技術(shù)合同認(rèn)定規(guī)則》（國(guó)科發(fā)政字〔2001〕253號(hào)）、《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局關(guān)于全面推開(kāi)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)的通知》(財(cái)稅〔2016〕36號(hào))、《財(cái)政部 國(guó)家稅務(wù)總局 科技部關(guān)于完善研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策的通知》(財(cái)稅〔2015〕119號(hào))等有關(guān)規(guī)定，進(jìn)一步優(yōu)化和完善技術(shù)市場(chǎng)政策體系，促進(jìn)科技與經(jīng)濟(jì)結(jié)合，保障國(guó)家有關(guān)技術(shù)市場(chǎng)稅收優(yōu)惠政策的落實(shí)，結(jié)合實(shí)際，制定本辦法。
第二條 本辦法適用于在深圳市（包括深汕合作區(qū)，以下同）依法登記注冊(cè)并納稅的法人、其他組織，或者在深圳市依法納稅的個(gè)人從事技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、許可業(yè)務(wù)和與之相關(guān)的技術(shù)咨詢、服務(wù)業(yè)務(wù)取得的技術(shù)性收入申請(qǐng)享受稅收優(yōu)惠。
第三條 本辦法所稱技術(shù)合同是指當(dāng)事人就技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、許可、咨詢或者服務(wù)訂立的確立相互之間權(quán)利和義務(wù)的合同。
第四條 本辦法所稱技術(shù)開(kāi)發(fā)是指當(dāng)事人之間就新技術(shù)、新產(chǎn)品、新工藝、新品種或者新材料及其系統(tǒng)的研究開(kāi)發(fā)的行為，技術(shù)開(kāi)發(fā)包括委托開(kāi)發(fā)和合作開(kāi)發(fā)。
技術(shù)轉(zhuǎn)讓是指合法擁有技術(shù)的權(quán)利人,將現(xiàn)有特定的專利、專利申請(qǐng)、技術(shù)秘密的相關(guān)權(quán)利讓與他人的行為，技術(shù)轉(zhuǎn)讓包括專利權(quán)轉(zhuǎn)讓、專利申請(qǐng)權(quán)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)秘密轉(zhuǎn)讓、其他技術(shù)轉(zhuǎn)讓等。
技術(shù)許可是指合法擁有技術(shù)的權(quán)利人,將現(xiàn)有特定的專利、技術(shù)秘密的相關(guān)權(quán)利許可他人實(shí)施、使用的行為，技術(shù)許可包括專利實(shí)施許可、技術(shù)秘密使用許可等。
技術(shù)咨詢是指當(dāng)事人一方以技術(shù)知識(shí)為對(duì)方就特定技術(shù)項(xiàng)目提供可行性論證、技術(shù)預(yù)測(cè)、專題技術(shù)調(diào)查、分析評(píng)價(jià)報(bào)告等的行為。
技術(shù)服務(wù)是指當(dāng)事人一方以技術(shù)知識(shí)為對(duì)方解決特定技術(shù)問(wèn)題所的行為。
第五條 本辦法所稱技術(shù)交易賣方是指技術(shù)開(kāi)發(fā)、服務(wù)、咨詢合同的受托方，或者技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同的讓與方,或者技術(shù)許可合同的許可方等。
技術(shù)交易買方是指技術(shù)開(kāi)發(fā)、服務(wù)、咨詢合同的委托方，或者技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同的受讓方,或者技術(shù)許可合同的被許可方等。
第六條 本辦法所稱稅收優(yōu)惠是指國(guó)家規(guī)定的符合條件的技術(shù)合同技術(shù)性收入免征增值稅、技術(shù)轉(zhuǎn)讓所得減免企業(yè)所得稅、企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除以及科技人員取得職務(wù)科技成果轉(zhuǎn)化現(xiàn)金獎(jiǎng)勵(lì)減免個(gè)人所得稅等。
第二章 職責(zé)分工
第七條 市主管稅務(wù)機(jī)關(guān)負(fù)責(zé)我市納稅人技術(shù)性收入減免稅事項(xiàng)管理工作，并開(kāi)展后續(xù)管理和監(jiān)督檢查，對(duì)不應(yīng)當(dāng)享受減免稅的，依法追繳已享受的減免稅款，并予以相應(yīng)處理。
第八條 市科技行政管理部門負(fù)責(zé)我市技術(shù)合同認(rèn)定登記管理工作，對(duì)申請(qǐng)認(rèn)定登記的技術(shù)合同，經(jīng)審核符合規(guī)定的，給予出具相應(yīng)的認(rèn)定登記證明。
第九條 納稅人申請(qǐng)技術(shù)性收入減免稅應(yīng)當(dāng)符合本辦法第二、八條的相關(guān)規(guī)定和具備相應(yīng)的減免稅資質(zhì)，自行辦理納稅申報(bào)并享受稅收優(yōu)惠，同步做好相關(guān)資料留存?zhèn)洳楣ぷ鳌?br />
第三章 技術(shù)合同認(rèn)定登記
第十條 技術(shù)合同認(rèn)定登記實(shí)行按地域一次登記制度，應(yīng)當(dāng)由技術(shù)交易賣方提出申請(qǐng)技術(shù)合同認(rèn)定登記，涉外合同且技術(shù)交易賣方為境外的，可由技術(shù)交易買方提出申請(qǐng)。
第十一條 納稅人申請(qǐng)辦理技術(shù)合同認(rèn)定登記事項(xiàng)，應(yīng)當(dāng)以書(shū)面形式或者電子掃描件向市科技行政管理部門提交完整的技術(shù)合同和相關(guān)附件，包括合同中購(gòu)置設(shè)備等非技術(shù)性費(fèi)用的詳細(xì)清單。經(jīng)認(rèn)定登記的技術(shù)合同，市科技行政管理部門應(yīng)當(dāng)留存相應(yīng)的紙質(zhì)申請(qǐng)資料。
第十二條 技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)采用書(shū)面形式訂立，納稅人可以使用由國(guó)家科技部監(jiān)制的技術(shù)合同示范文本。采用其他書(shū)面合同文本的，應(yīng)當(dāng)符合《中華人民共和國(guó)民法典》的有關(guān)規(guī)定。
第十三條 納稅人為法人的，其技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)有其法定代表人或者其授權(quán)的人員在合同上簽名或者蓋章，并加蓋法人的公章或者合同專用章；納稅人為個(gè)人的，其技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)有其本人在合同上簽名或者蓋章；納稅人為其他組織的，其技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)有該組織負(fù)責(zé)人在合同上簽名或者蓋章，并加蓋組織的印章。
第十四條 經(jīng)認(rèn)定符合登記條件的技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)按技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、咨詢或者服務(wù)合同予以分類登記，技術(shù)許可合同在認(rèn)定登記時(shí)可按技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同予以登記，但國(guó)家另有規(guī)定的除外。
第十五條 市科技行政管理部門依據(jù)技術(shù)合同的申請(qǐng)登記類別可出具以下兩類認(rèn)定登記證明：
（一）《深圳市技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)及相關(guān)服務(wù)性收入認(rèn)定登記證明》（以下簡(jiǎn)稱“第一類證明”），登記類別為登記類別為享受增值稅及企業(yè)所得稅相關(guān)優(yōu)惠，且限于技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)、許可及相關(guān)技術(shù)咨詢、服務(wù)合同辦理。
與技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)、許可相關(guān)的技術(shù)咨詢、服務(wù)業(yè)務(wù)是指技術(shù)交易賣方根據(jù)技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)或者許可合同的規(guī)定，為幫助技術(shù)交易買方掌握所委托開(kāi)發(fā)（或轉(zhuǎn)讓、許可）的技術(shù)，提供的技術(shù)咨詢、服務(wù)業(yè)務(wù)。
（二）《深圳市技術(shù)合同認(rèn)定登記證明》（以下簡(jiǎn)稱“第二類證明”），登記類別為享受除增值稅以外的其他稅收優(yōu)惠。
同一份技術(shù)合同應(yīng)當(dāng)只選擇一種登記類別，不可同時(shí)以及重復(fù)申請(qǐng)。
第四章 技術(shù)性收入核定
第十六條 以圖紙、資料等為載體提供已有技術(shù)或開(kāi)發(fā)成果的，其技術(shù)性收入為向?qū)Ψ绞杖〉娜績(jī)r(jià)款和價(jià)外費(fèi)用。
第十七條 以樣品、樣機(jī)、設(shè)備等貨物為載體提供已有技術(shù)或開(kāi)發(fā)成果的，其技術(shù)性收入不包括貨物的價(jià)值。
第十八條 提供生物技術(shù)時(shí)附帶提供的微生物菌種母本和動(dòng)、植物新品種的，其技術(shù)性收入包括入內(nèi)。
第十九條 除第十六條至第十八條規(guī)定的情形外，其他技術(shù)合同的技術(shù)性收入是指從技術(shù)合同成交額中扣除為委托方或受讓方購(gòu)置設(shè)備、儀器、零部件、原材料等非技術(shù)性費(fèi)用后的剩余金額，但合理數(shù)量標(biāo)的物的直接成本可計(jì)入內(nèi)，具體數(shù)量參照國(guó)家科技部的相關(guān)技術(shù)合同認(rèn)定規(guī)則執(zhí)行。
第五章 納稅人減免稅辦理
第二十條 納稅人享受技術(shù)性收入減免稅事項(xiàng)優(yōu)惠采取“自行判別、申報(bào)享受、相關(guān)資料留存?zhèn)洳?rdquo;的辦理方式，應(yīng)當(dāng)先完成技術(shù)合同的認(rèn)定登記，然后在納稅申報(bào)時(shí)直接享受稅收優(yōu)惠，并歸集和留存技術(shù)合同相關(guān)資料，以備市主管稅務(wù)機(jī)關(guān)核查。
第二十一條 納稅人憑本辦法第十五條規(guī)定的第一、二類證明可向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申請(qǐng)享受稅收優(yōu)惠，但第二類證明不得享受免征增值稅。
第二十二條 與技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、許可相關(guān)的技術(shù)咨詢、服務(wù)享受免征增值稅時(shí)，納稅人應(yīng)當(dāng)是原技術(shù)交易賣方，且這部分技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)的價(jià)款與技術(shù)轉(zhuǎn)讓或者技術(shù)開(kāi)發(fā)的價(jià)款應(yīng)當(dāng)在同一張發(fā)票上開(kāi)具。
第二十三條 未經(jīng)市科技行政管理部門認(rèn)定登記的技術(shù)合同，不得享受相關(guān)稅收優(yōu)惠。
第二十四條 市主管稅務(wù)機(jī)關(guān)應(yīng)當(dāng)對(duì)已享受減免稅的納稅人進(jìn)行事后監(jiān)督檢查，檢查中發(fā)現(xiàn)市科技行政管理部門的認(rèn)定技術(shù)合同有誤的，可以要求市科技行政管理部門重新認(rèn)定，對(duì)不應(yīng)當(dāng)享受減免稅的，取消納稅人的優(yōu)惠資格，追繳已享受的減免稅款，并依照稅收征管法的有關(guān)規(guī)定處理。
第六章 附則
第二十五條 納稅人對(duì)市科技行政管理部門的認(rèn)定結(jié)論有異議的，可以按照《中華人民共和國(guó)行政復(fù)議法》的規(guī)定申請(qǐng)行政復(fù)議。
第二十六條 本辦法自發(fā)布之日起施行。原深圳市地方稅務(wù)局、深圳市科學(xué)技術(shù)局發(fā)布的《深圳市技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)開(kāi)發(fā)及相關(guān)服務(wù)性收入免征營(yíng)業(yè)稅審批管理辦法》（深地稅發(fā)〔2003〕348號(hào)）同時(shí)廢止。
《深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（意見(jiàn)征求稿）》起草說(shuō)明
現(xiàn)就起草《深圳市技術(shù)合同技術(shù)性收入享受稅收優(yōu)惠管理辦法（意見(jiàn)征求稿）》（以下簡(jiǎn)稱《管理辦法》）作如下說(shuō)明。
一、起草背景
2000年科技部、財(cái)政部和國(guó)家稅務(wù)總局印發(fā)了《技術(shù)合同認(rèn)定登記管理辦法》（國(guó)發(fā)科政字〔2000〕063號(hào)，以下簡(jiǎn)稱63號(hào)文），按管理辦法的有關(guān)規(guī)定，主要包括以下三個(gè)方面：一是技術(shù)合同是當(dāng)事人就技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、咨詢或者服務(wù)訂立的確立相互之間權(quán)利和義務(wù)的合同；二是市科技行政管理部門管理我市技術(shù)合同認(rèn)定登記工作，對(duì)申請(qǐng)認(rèn)定登記的技術(shù)合同，經(jīng)審核符合規(guī)定的，給予出具相應(yīng)的認(rèn)定登記證明；三是當(dāng)事人可持認(rèn)定登記證明，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提出申請(qǐng)，經(jīng)審核后，可享受國(guó)家規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策。
但63號(hào)文并未對(duì)可免稅的技術(shù)合同范圍、認(rèn)定登記證明樣式以及辦理免稅流程等作出明確的規(guī)定，為此，2003年原深圳市地方稅務(wù)局、深圳市科學(xué)技術(shù)局聯(lián)合印發(fā)了《深圳市技術(shù)轉(zhuǎn)讓技術(shù)開(kāi)發(fā)及相關(guān)服務(wù)性收入免征營(yíng)業(yè)稅審批管理辦法》（深地稅發(fā)〔2003〕348號(hào)，以下簡(jiǎn)稱348號(hào)文），一直沿用到現(xiàn)在，按348號(hào)的有關(guān)規(guī)定，經(jīng)市科技行政管理部門認(rèn)定登記的技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)開(kāi)發(fā)業(yè)務(wù)和與之相關(guān)的技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)業(yè)務(wù)取得的技術(shù)性收入可享受免征營(yíng)業(yè)稅的稅收優(yōu)惠政策。
2009年，國(guó)家稅務(wù)總局印發(fā)了《關(guān)于技術(shù)轉(zhuǎn)讓所得減免企業(yè)所得稅有關(guān)問(wèn)題的通知》，明確了企業(yè)發(fā)生境內(nèi)技術(shù)轉(zhuǎn)讓向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)辦理減免稅備案手續(xù)時(shí)，應(yīng)報(bào)送省級(jí)以上科技部門出具的技術(shù)合同登記證明等資料方可享受減免企業(yè)所得稅優(yōu)惠。為了更加規(guī)范技術(shù)合同認(rèn)定登記的工作程序，同年原市科技局先后印發(fā)《關(guān)于對(duì)在深圳設(shè)立研發(fā)機(jī)構(gòu)的開(kāi)發(fā)合同進(jìn)行登記的意見(jiàn)》、《關(guān)于對(duì)計(jì)算機(jī)軟件合同進(jìn)行認(rèn)定登記的規(guī)則》以及《關(guān)于對(duì)涉密合同認(rèn)定登記工作的規(guī)則》，對(duì)科技部出臺(tái)的《技術(shù)合同認(rèn)定規(guī)則》（國(guó)科發(fā)政字〔2001〕253號(hào)）中相關(guān)條款進(jìn)行了補(bǔ)充和解釋。
2015年以來(lái)，越來(lái)越多的申請(qǐng)認(rèn)定登記的技術(shù)合同不僅限于免征營(yíng)業(yè)稅，主要由于2015年國(guó)家稅務(wù)總局發(fā)布了《關(guān)于企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除政策有關(guān)問(wèn)題的公告》，明確企業(yè)研發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除實(shí)行備案管理，提到企業(yè)留存?zhèn)洳榈馁Y料應(yīng)包括經(jīng)科技行政主管部門登記的委托、合作研究開(kāi)發(fā)項(xiàng)目的合同。
到了2016年由于營(yíng)改增的全面實(shí)施，財(cái)政部、國(guó)家稅務(wù)總局印發(fā)了《關(guān)于全面推開(kāi)營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)的通知》（財(cái)稅〔2016〕36號(hào)），在附件3《營(yíng)業(yè)稅改征增值稅試點(diǎn)過(guò)渡政策的規(guī)定》中明確了技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)開(kāi)發(fā)和與之相關(guān)的技術(shù)咨詢、技術(shù)服務(wù)免征增值稅，與348號(hào)文可免稅的技術(shù)合同范圍一致。
2018年，財(cái)政部、稅務(wù)總局、科技部印發(fā)了《關(guān)于科技人員取得職務(wù)科技成果轉(zhuǎn)化現(xiàn)金獎(jiǎng)勵(lì)有關(guān)個(gè)人所得稅政策的通知》（財(cái)稅〔2018〕58號(hào)），明確了從職務(wù)科技成果轉(zhuǎn)化收入中給予科技人員的現(xiàn)金獎(jiǎng)勵(lì)，可減按50%計(jì)入科技人員當(dāng)月“工資、薪金所得”。我市納稅人在辦理相關(guān)個(gè)人所得稅減免事項(xiàng)時(shí)，其科技成果項(xiàng)目應(yīng)經(jīng)市科技主管行政部門備案，并向深圳市稅務(wù)局提交《科技人員取得職務(wù)科技成果轉(zhuǎn)化現(xiàn)金獎(jiǎng)勵(lì)個(gè)人所得稅備案表》。
2020年5月，十三屆全國(guó)人大三次會(huì)議表決通過(guò)了《中華人民共和國(guó)民法典》（以下簡(jiǎn)稱“《民法典》”），其中涉及技術(shù)合同的的條款共四十五條,對(duì)部分技術(shù)合同條款作了適當(dāng)修改，在原技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同的基礎(chǔ)上分為技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同和技術(shù)許可合同，增加了其他知識(shí)產(chǎn)權(quán)的轉(zhuǎn)讓和許可、工作費(fèi)用的負(fù)擔(dān)等條款。
考慮到348號(hào)文是2003年4月8日原深圳市地方稅務(wù)局、深圳市科學(xué)技術(shù)局發(fā)布的，至今已經(jīng)有17年，并未包含上述提及的研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除、營(yíng)業(yè)稅改增值稅和技術(shù)合同類型增加等，由于營(yíng)業(yè)稅和增值稅都屬于流轉(zhuǎn)稅，當(dāng)時(shí)經(jīng)過(guò)與原市國(guó)稅局協(xié)商，從2016年起出具的符合免稅條件的認(rèn)定證明由“符合免征營(yíng)業(yè)稅”過(guò)渡為“符合免征流轉(zhuǎn)稅”（實(shí)際就是免征增值稅），當(dāng)事人憑認(rèn)定登記證明繼續(xù)享受國(guó)家規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策。尤其近兩年，由于需要辦理企業(yè)所得稅減免和企業(yè)研發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除等事項(xiàng)，當(dāng)事人申請(qǐng)辦理認(rèn)定登記的技術(shù)合同逐漸增加，一定程度上彌補(bǔ)了“營(yíng)改增”后申請(qǐng)“免征流轉(zhuǎn)稅”的技術(shù)合同減少（主要是由于另一方當(dāng)事人要求開(kāi)具不免稅的增值稅專用發(fā)票，造成了部分當(dāng)事人不再申請(qǐng)技術(shù)合同的認(rèn)定登記），同時(shí)考慮348號(hào)文中主要涉及都是營(yíng)業(yè)稅方面的表述，在實(shí)際開(kāi)展技術(shù)合同認(rèn)定工作中部分條款已過(guò)時(shí)或者不適用，為了適應(yīng)新形勢(shì)的發(fā)展，更是要做好與《民法典》關(guān)于技術(shù)合同方面的銜接工作，有必要對(duì)348號(hào)文進(jìn)行重新修訂。
二、設(shè)立目的
為了進(jìn)一步優(yōu)化和完善技術(shù)市場(chǎng)政策體系，促進(jìn)科技與經(jīng)濟(jì)結(jié)合，保障國(guó)家有關(guān)技術(shù)市場(chǎng)稅收優(yōu)惠政策的落實(shí)，對(duì)348號(hào)文進(jìn)行重新修訂，按照修訂后的《管理辦法》的有關(guān)規(guī)定，市科技行政管理部門管理我市技術(shù)合同認(rèn)定登記工作，對(duì)申請(qǐng)認(rèn)定登記的技術(shù)合同，經(jīng)審核符合規(guī)定的，給予出具相應(yīng)的認(rèn)定登記證明。納稅人可持認(rèn)定登記證明，向主管稅務(wù)機(jī)關(guān)提出申請(qǐng)，經(jīng)審核后，可享受國(guó)家規(guī)定的稅收優(yōu)惠政策。
三、起草過(guò)程
（一）我市的技術(shù)合同認(rèn)定登記工作情況
近年來(lái)，技術(shù)交易數(shù)據(jù)應(yīng)用日趨廣泛。2018年，廣東省將技術(shù)合同納入全省創(chuàng)新驅(qū)動(dòng)發(fā)展“八大舉措”的監(jiān)測(cè)評(píng)估指標(biāo)體系，建立起全省技術(shù)合同認(rèn)定登記的評(píng)價(jià)監(jiān)測(cè)和動(dòng)態(tài)發(fā)布工作機(jī)制。國(guó)家科技部將人均技術(shù)合同交易額和技術(shù)轉(zhuǎn)移機(jī)構(gòu)作為國(guó)家級(jí)高新區(qū)重要評(píng)價(jià)指標(biāo)。市科技創(chuàng)新委每年受理認(rèn)定登記申請(qǐng)的技術(shù)合同份數(shù)超過(guò)12000份。截至2018年，我市認(rèn)定登記的技術(shù)合同交易額一直位于全省第一名，占全省技術(shù)合同交易額的60%以上。截至今年5月末，我市共認(rèn)定登記技術(shù)合同3661份，占全省的50%，技術(shù)合同交易額為525億元，占全省的86%，其中，登記類別為“免征流轉(zhuǎn)稅”的技術(shù)合同份數(shù)2419份，技術(shù)合同交易額171億元；登記類別為“其他”的技術(shù)合同份數(shù)1242份，技術(shù)合同交易額較往年有大幅增加，為354億元，占我市技術(shù)合同交易的67%。經(jīng)調(diào)研，登記類別為“其他”的技術(shù)合同主要用于企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除。
今年疫情防控期間，市科技創(chuàng)新委及時(shí)啟動(dòng)開(kāi)發(fā)業(yè)務(wù)系統(tǒng)全流程網(wǎng)上業(yè)務(wù)辦理功能模塊，從4月21日起，正式對(duì)外提供網(wǎng)上辦理技術(shù)合同認(rèn)定登記服務(wù)，深圳成為我省第一個(gè)實(shí)現(xiàn)技術(shù)合同認(rèn)定登記證明 “無(wú)紙化”的城市,申請(qǐng)人只需要通過(guò)登陸系統(tǒng)填報(bào)相關(guān)信息，并上傳合同原件和相關(guān)附件掃描件，即可實(shí)現(xiàn)線上核查。系統(tǒng)上線以來(lái)通過(guò)網(wǎng)上辦理方式申請(qǐng)的技術(shù)合同為1493份，通過(guò)現(xiàn)場(chǎng)辦理方式申請(qǐng)的技術(shù)合同為556份，網(wǎng)上辦理方式申請(qǐng)的技術(shù)合同所占比重為72%，真正做到“零接觸、零跑腿”。
（二）編制思路
為了適應(yīng)技術(shù)合同認(rèn)定登記工作新形勢(shì)，規(guī)范我市技術(shù)合同認(rèn)定工作，與國(guó)家稅務(wù)總局、財(cái)政部和科技部的最新政策銜接，2020年6月起，市科技創(chuàng)新委啟動(dòng)了348號(hào)文的修訂工作，編制時(shí)主要考慮如下：一是刪除營(yíng)業(yè)稅方面的表述，2017年10月30日國(guó)務(wù)院常務(wù)會(huì)議通過(guò)了《國(guó)務(wù)院關(guān)于廢止〈中華人民共和國(guó)營(yíng)業(yè)稅暫行條例〉和修改〈中華人民共和國(guó)增值稅暫行條例〉的決定（草案）》，營(yíng)業(yè)稅已經(jīng)正式廢止，市科技創(chuàng)新委需要將348號(hào)文中涉及營(yíng)業(yè)稅的表述進(jìn)行修改，用增值稅或者技術(shù)性收入等進(jìn)行替換；二是擴(kuò)充技術(shù)合同技術(shù)性收入可享受稅收優(yōu)惠范圍，增加減免企業(yè)所得稅、企業(yè)研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用稅前加計(jì)扣除以及科技人員取得職務(wù)科技成果轉(zhuǎn)化現(xiàn)金獎(jiǎng)勵(lì)個(gè)人所得稅減免等表述；三是更新聯(lián)合發(fā)文的部門名稱，348號(hào)是原深圳市地方稅務(wù)局、深圳市科學(xué)技術(shù)局聯(lián)合發(fā)布，經(jīng)過(guò)機(jī)構(gòu)改革，相關(guān)部門的名稱早已經(jīng)發(fā)生變更，經(jīng)此次修改，希望以市稅務(wù)局、市科技創(chuàng)新委名義聯(lián)合發(fā)布新的《管理辦法》；四是修改部分過(guò)時(shí)或者不適用的條款，如348號(hào)的第十一條，關(guān)于申請(qǐng)人已在市對(duì)外貿(mào)易經(jīng)濟(jì)合作部門登記注冊(cè)并取得《技術(shù)進(jìn)口合同登記證書(shū)》的不需要市科學(xué)技術(shù)局申請(qǐng)技術(shù)合同認(rèn)定登記的表述，按目前市稅務(wù)局實(shí)際的工作程序，申請(qǐng)人仍需要到市科技創(chuàng)新委申請(qǐng)技術(shù)合同認(rèn)定登記，在本次修訂中，此條款將會(huì)被刪除。
四、主要內(nèi)容
《管理辦法》共分為六章，共二十六條，主要包括總則、職責(zé)分工、技術(shù)合同認(rèn)定登記、技術(shù)性收入核定、納稅人減免稅辦理等。
（一）總則
《管理辦法》的第一至六條列明了政策依據(jù)、適用范圍、技術(shù)合同定義、技術(shù)合同類型、技術(shù)交易買賣雙方和相關(guān)稅收優(yōu)惠政策，主要修改情況如下：
1.對(duì)348號(hào)文的中第一至三條進(jìn)行了重新修訂，移至《管理辦法》的第一、二、四條。按《民法典》的有關(guān)規(guī)定，新增《管理辦法》第三條關(guān)于技術(shù)合同定義。《管理辦法》第四條在原有的“技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同”細(xì)分為 “技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同”和“技術(shù)許可合同”，由原“四技合同”變成了“五技合同”，在“技術(shù)開(kāi)發(fā)”定義中增加“新品種”的相關(guān)表述，“技術(shù)轉(zhuǎn)讓”定義中刪減“使用權(quán)”的相關(guān)表述，以及對(duì)“技術(shù)許可”作了明確的規(guī)定。
2.《管理辦法》第五和六條為新增條款。第五條明確了技術(shù)交易賣方和買方范圍。原348號(hào)中當(dāng)事人只涉及免征營(yíng)業(yè)稅，為了擴(kuò)大享受稅收優(yōu)惠政策的范圍，第六條明確了納稅人可享受免征增值稅，減免企業(yè)所得稅以及研究開(kāi)發(fā)費(fèi)用加計(jì)扣除等。
（二）職責(zé)分工
《管理辦法》的第七至九條為新增條款，列明了主管稅務(wù)機(jī)關(guān)、市科技行政管理部門和納稅人相關(guān)職責(zé)。市主管稅務(wù)機(jī)關(guān)負(fù)責(zé)我市納稅人技術(shù)性收入減免稅事項(xiàng)管理工作，并進(jìn)行后續(xù)管理和監(jiān)督檢查。市科技行政管理部門負(fù)責(zé)我市技術(shù)合同認(rèn)定登記管理工作。納稅人無(wú)需對(duì)已認(rèn)定登記的技術(shù)合同進(jìn)行前置備案，在納稅申報(bào)時(shí)可直接享受技術(shù)性收入減免稅優(yōu)惠，但需要將技術(shù)合同相關(guān)資料留存和歸集整齊，并整理完成，以備主管稅務(wù)機(jī)關(guān)核查。
（三）技術(shù)合同認(rèn)定登記
《管理辦法》的第十至十五條列明了辦理方式、技術(shù)合同類型、登記類別以及對(duì)應(yīng)的登記證明等?！豆芾磙k法》第十、十四條為新增條款。對(duì)348號(hào)文第八、九、十、十二條進(jìn)行重新修訂，移至《管理辦法》的第十一、十三、十二、十五條，同時(shí)刪除348號(hào)文第十一條。主要修改情況如下：
1.業(yè)務(wù)辦理方式：涉及《管理辦法》第十至十三條內(nèi)容，明確一般由技術(shù)交易賣方申請(qǐng)技術(shù)合同認(rèn)定登記，涉外合同，可由技術(shù)交易買方申請(qǐng)；目前市科技創(chuàng)新委對(duì)外提供現(xiàn)場(chǎng)和網(wǎng)上兩種方式辦理技術(shù)合同認(rèn)定登記業(yè)務(wù)，納稅人可現(xiàn)場(chǎng)提交或者郵寄書(shū)面合同文本和相關(guān)附件進(jìn)行線下核查，也可在提交合同原件和相關(guān)附件掃描件（PDF格式）進(jìn)行線上核查。
2.技術(shù)合同類型：按照63號(hào)文的第二條規(guī)定，經(jīng)認(rèn)定符合登記條件的技術(shù)合同可按技術(shù)開(kāi)發(fā)、轉(zhuǎn)讓、咨詢或者服務(wù)合同進(jìn)行分類登記，但《民法典》新增了技術(shù)許可合同，考慮到技術(shù)許可合同是從原技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同細(xì)分出來(lái)的，為了保持分類登記的一致性，《管理辦法》第十四條明確了技術(shù)許可合同在認(rèn)定登記時(shí)可參照技術(shù)轉(zhuǎn)讓合同予以登記，但國(guó)家另有規(guī)定的除外。
3.合同登記類別：《管理辦法》第十五條中，結(jié)合目前實(shí)際工作情況，以及依據(jù)348號(hào)文，市科技行政管理部門對(duì)符合規(guī)定的技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)及相關(guān)技術(shù)服務(wù)、技術(shù)咨詢合同，會(huì)出具《深圳市技術(shù)轉(zhuǎn)讓、開(kāi)發(fā)及相關(guān)服務(wù)性收入認(rèn)定登記證明》，登記類別為“享受增值稅及企業(yè)所得稅相關(guān)優(yōu)惠”；對(duì)于不符合免征增值稅，但符合認(rèn)定登記條件的技術(shù)合同，市科技行政管理部門會(huì)出具《深圳市技術(shù)合同認(rèn)定登記證明》（以下簡(jiǎn)稱“第二類證明”）, 登記類別為“享受除增值稅以外的其他稅收優(yōu)惠”。第二類證明除了不可享受免征增值稅優(yōu)惠以外，享受的其他稅收優(yōu)惠政策與第一類證明一致。
（四）技術(shù)性收入核定
《管理辦法》的第十六至十九條列明了如何核定技術(shù)合同技術(shù)性收入。對(duì)348號(hào)第四至第七條進(jìn)行了重新修訂，分別移至《管理辦法》的第十六至十八條，原348號(hào)文中涉及“免稅營(yíng)業(yè)額”的表述都修改為“技術(shù)性收入”。《管理辦法》中“技術(shù)性收入”是為了和《技術(shù)合同認(rèn)定規(guī)則》的合同交易總額和技術(shù)交易額區(qū)分：合同交易總額是指技術(shù)合同成交項(xiàng)目的總金額；技術(shù)交易額是指從合同交易總額中扣除購(gòu)置設(shè)備、儀器、零部件、原材料等非技術(shù)性費(fèi)用后的剩余金額，但合理數(shù)量標(biāo)的物的直接成本不計(jì)入非技術(shù)性費(fèi)用。除了第十六至十八條對(duì)個(gè)別情況的技術(shù)性收入進(jìn)行確認(rèn)，《管理辦法》第十九條明確了技術(shù)性收入一般為技術(shù)交易額，同時(shí)也是為了與348號(hào)文的“技術(shù)性收入”的相關(guān)表述保持一致。
（五）納稅人減免稅辦理
《管理辦法》的第二十至二十四條列明了納稅人減免稅辦理相關(guān)程序?！豆芾磙k法》的第二十條為新增條款，明確了納稅人技術(shù)性收入減免稅事項(xiàng)優(yōu)惠的辦理方式。對(duì)348號(hào)文第十六條的技術(shù)咨詢和技術(shù)服務(wù)合同如何辦理免征增值稅行重新修訂，移至《管理辦法》的二十二條。對(duì)348號(hào)文的第十四、十五進(jìn)行刪除，《管理辦法》的第二十一、二十三條為新增條款，分別明確了兩類認(rèn)定登記證明可適用的稅收優(yōu)惠范圍，以及未認(rèn)定登記的技術(shù)合同不得享受稅收優(yōu)惠。對(duì)348號(hào)文的第十七條涉及審核免征營(yíng)業(yè)稅內(nèi)容進(jìn)行修改，改為市主管稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)納稅人進(jìn)行事后監(jiān)督檢查，移至《管理辦法》的第二十四條。
（六）附則
《管理辦法》的第二十五至二十六條列明了可對(duì)有異議的技術(shù)合同認(rèn)定結(jié)論進(jìn)行行政復(fù)議，以及本辦法的生效日期等。
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